Las aguas tranquilas de Puerto Vallarta permiten que la práctica del kayak sea muy popular tanto en río, como en mar y presas. Además, gracias a la abundante fauna marina, la experiencia de remar en aguas claras y de un azul intenso se complementa, según la época del año, con la observación de delfines, mantarrayas gigantes, tiburones y hasta ballenas.

Algunas de las mejores zonas para practicar el kayakismo en Puerto Vallarta y sus alrededores son el río Ameca, que desemboca en la zona de Boca de Tomates, en Bahía de Banderas; y las playas de Boca de Tomatlán, Colomitos, Majahuitas (playa de gran belleza sólo accesible en lancha) y las Islas Marietas. Aunque si se desea una experiencia aún más tranquila, la Presa Cajón de Peñas, aproximadamente a hora y media de Vallarta, es también una alternativa.

Remar entre enormes rocas y acantilados, llegar a sitios tranquilos y conocer de cerca la fauna marina de Puerto Vallarta es posible en kayaks para una o más personas. Muchos organizadores de actividades rentan el equipo desde la Marina de Vallarta, y ofrecen paquetes para principiantes, con los que muchos kayakistas complementan su experiencia practicando esnórquel y conociendo desde otra perspectiva la increíble belleza del Pacífico mexicano.